Nunca se deve fazer isso!
Sempre que se toca nalgum componente electrico, o carro não deve estar ligado, nem sequer a ignição ON, e na maioria das vezes, deve-se inclusivé desligar o borne negativo da bateria (é mais seguro!)
Por vezes há erros e danos irrecuperáveis apenas devido a pormenores como esse.
Ao teres mexido no comando, pode ter momentaneamente ter feito algum mau contacto nas ligações ou desligado algum fio e originado esse erro. Entra no vag-com, limpa o erro e verifica se se mantem.