Então tira esse sistema fora.Alguém me chamou ao fórum, e cá vim dar a ajuda pedida.
Reparei que estava em falta neste tópico, segue a explicação para o motor parar:
tenho um comando Laserline T108 do alarme que controla as portas, o fecho dos vidros, e o alarme, e tenho uma chave electrónica do motor que é alimentada por uma pilha. Quando a pilha falha o motor desliga.
Solução, trazer sempre uma pilha no carro para substituir quando acontecer.
Há problemas maiores.