Pode sim.
Mas convém confirmar se está tudo bem sangrado, se o anticongelante saiu quase todo, convém sangrar correctamente, e o ventilador tem duas velocidades, convém ver se as duas velocidades trabalham.
E o tubo fininho de retorno que vai ao vaso muitas vezes entope, convém confirmar isso também.
O problema é que tiraste a culaça fora sem motivo, até porque como disseste a culaça está boa e a junta não tem passagem.
Para um motor aquecer, tem de acontecer uma ou mais destas hipóteses:
1. Não tem anticongelante suficiente
2. Existe ar no circuito
3. O anticongelante não é refrigerado
4. O anticongelante não circula
Se o anticongelante não desaparece, nem a junta nem a culaça estão a dar passagem.